Херсонська загальноосвітня школа ІІ-ІІІ ступенів Херсонської міської ради співпрацює з такими організаціями:
- Державними установами:
- управління освіти Херсонської міської ради;
- методичний кабінет при управлінні освіти Херсонської міської ради;
- міське комунальне підприємство “Виробниче управління водопровідно – каналізаційного господарства м. Херсона”;
- Служби у справах дітей Херсонської міської ради;
- відділ ювенальної превенції ГУНП;
- бібліотека-філія для дітей та юнацтва №13 ім. Б.Грінченка;
- спеціалізована дитячо-юнацька спортивна школа №2;
- Херсонська академія неперервної освіти;
- Херсонський центр спортивно-оздоровчої роботи “Юнга”;
- Херсонський міський центр науково-технічної творчості учнівської молоді Херсонської міської ради.
- Громадськими організаціями:
- МБФ «Міжнародний Альянс з ВІЛ/СНІДу в Україні»;
- Херсонська міська громадська молодіжна організація «Анастасіс»;
- Херсонська обласна організація товариства Червоного Хреста в Україні;